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Thèse

Diversity of Bartonella species circulating within a population of sylvatic rodents in a suburban forest, the Sénart forest

Résumé : Les bactéries du genre Bartonella sont des alpha-proteobacteria intracellulaires facultatives, capables d'infecter les érythrocytes d'une multitude d'espèces de mammifères. A ce jour, 33 espèces de Bartonella ont été recensées incluant une vingtaine d'espèces identifiées chez des rongeurs, dont certaines sont associées à des maladies chez l'homme. Des études provenant de différentes parties du monde montrent que les populations de rongeurs hébergent une grande diversité d'espèces de Bartonella avec des taux de prévalence élevés. Plusieurs facteurs liés à l'hôte, au vecteur et à l'environnement dans lequel ils évoluent influencent et auraient, par le passé façonné cette diversité. L'objectif de cette thèse a été d'élucider certains de ces facteurs en étudiant la diversité des souches de Bartonella circulant au sein d'une population de rongeurs sylvatiques dans une zone de forêt périurbaine française, la forêt de Sénart. Dans un premier temps, en nous basant sur une phylogénie précise et robuste, nous avons identifié 63 génotypes apparentés à 3 espèces connues de Bartonella (B. taylorii, B. grahamii et B. doshiae) communément retrouvées au sein des rongeurs sylvatiques en Europe et à une nouvelle espèce proche de B. rochalimae. Nous avons montré que la majorité des souches obtenues lors de cette étude sont fortement associées soit aux campagnols roussâtres soit aux mulots sylvestres. Malgré la barrière physique liée à la spécificité d'hôte, nous avons observé des échanges de matériel génétique entre les souches de Bartonella associées aux campagnols roussâtres et les souches adaptées aux mulots, suggérant que ces souches peuvent cohabiter au sein de leur vecteur. Dans un second temps, en évaluant l'impact de l'espèce bactérienne Borrelia afzelii sur la présence et la diversité des souches de Bartonella au sein d'une population de campagnols roussâtres par des outils statistiques, nous avons observé des co-infections par les deux genres bactériens au sein d'un même rongeur, mais ces deux bactéries ne semble pas interagir.
Liste complète des métadonnées

https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-03683513
Contributeur : ABES STAR :  Contact
Soumis le : mardi 31 mai 2022 - 16:39:21
Dernière modification le : vendredi 5 août 2022 - 14:38:11

Fichier

Thse-JPBUFFET.pdf
Version validée par le jury (STAR)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03683513, version 1

Citation

Jean-Philippe Buffet. Diversity of Bartonella species circulating within a population of sylvatic rodents in a suburban forest, the Sénart forest. Ecology, environment. AgroParisTech, 2012. English. ⟨NNT : 2012AGPT0087⟩. ⟨tel-03683513⟩

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